In chimica organica capita spesso che lo stesso numero di atomi possano essere legati tra loro in modo diverso. Le diverse strutture che possono verificarsi prendono il nome di isomeri. 

Due isomeri possiedono lo stesso numero di atomi e perciò hanno la stessa formula bruta, ma hanno una diversa struttura.

A titolo di esempio confrontiamo l'alcol etilico e il dimetil-etere che sono appunto isomeri funzionali.

Le modalità con cui si presentano le diverse strutture dà luogo ad una precisa classificazione che è bene conoscere (vedi la teoria)